經(jīng)查原因是比較的兩個文件是使用utf-8編碼的，

并且代碼中存在中文字符（一般多為注釋內(nèi)的中文），比較的時候中文可能會顯示為亂碼。

找到了原因，解決起來就比較簡單了————指定winmerge字符編碼即可。

以中文版的winmerge為例，通過菜單依次定位

菜單編輯->選項->代碼頁->默認代碼頁：

選擇Custom codepage:

填入65001

這個65001就是uft-8的代碼頁

確定之后，重新進行文件對比，不再提示錯誤消息，代碼中的中文字符也顯示正常了。